BEMU atau Badan Eksekutif Mahasiswa Universitas merupakan badan non struktural unsur kelengkapan lembaga kemahasiswaan tertinggi di tingkat universitas yang berfungsi sebagai badan eksekutif dalam menyalurkan/mengakomodasikan aspirasi, mengembangkan penalaran, mengembangkan profesi akademik, serta mengembangkan soft skills dan kreativitas mahasiswa. BEMU dipimpin oleh seorang Presiden Mahasiswa.

BEMF atau Badan Eksekutif Mahasiswa Fakultas merupakan badan non struktural unsur kelengkapan lembaga kemahasiswaan tertinggi di tingkat fakultas dalam bidang eksekutif. BEMF dipimpin oleh seorang ketua. Di UNISBA terdapat 10 BEMF yang mewakili 10 Fakultas, yaitu Fakultas Syariah, Fakultas Dakwah, Fakultas Tarbiyah dan Keguruan, Fakultas Hukum, Fakultas Psikologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA), Fakultas Teknik, Fakultas Ilmu Komunikasi (FIKOM), Fakultas Ekonomi dan Bisnis, dan Fakultas Kedokteran.